Dit is de Linux-app genaamd isiKnock om online in Linux te draaien waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als isiKnockv1.0.0.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam isiKnock online uit om gratis in Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
isiKnock om online in Linux te draaien
PRODUCTBESCHRIJVING
Signaalroutes zijn complexe en met elkaar verweven processen. De verstoring van biologische systemen kan het gecompliceerde samenspel en de afhankelijkheden van padcomponenten onthullen.isiKnock is software voor het automatisch uitvoeren en visualiseren van knockouts in silico voor signaalroutes (Hannig et al. 2019). isiKnock voorspelt het knock-outgedrag op basis van de berekening van signaalstromen in stabiele toestand. Voor een uitleg van het concept van in silico knock-outs verwijzen we naar Scheidel et al. 2016 en Amstein et al. 2017.
Hannig et al. (2019) isiKnock: in silico knock-outs in signaleringsroutes, Bio-informatica, 35(5), 892-894
Amstein et al. (2017) Manatee-invarianten onthullen functionele paden in signaleringsnetwerken. BMC systeembiologie, 11(1), 72.
Scheidel et al. (2016) In silico knock-outstudies van xenofagische vangst van Salmonella. PLoS computationele biologie, 12(12), e1005200.
Voordelen
- Systeembiologie
- In siliconen knock-out
- verstoringen
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/molbi-isiknock/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.