Dit is de Linux-app met de naam MARAGAP waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als Data-Maragap.rar. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam MARAGAP gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
MARAGAP
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Dit artikel presenteert 'MARAGAP', een door referentie ondersteunde pijplijn voor genoomassemblage. MARAGAP gebruikt het principe van Minimum Description Length om de optimale referentievolgorde voor de assemblage te bepalen. De optimale referentiesequentie wordt gebruikt als een sjabloon om inversies, inserties, deleties en SNP's in het doelgenoom af te leiden. MARAGAP gebruikt een algoritmische benadering om inversies en deleties te detecteren en te corrigeren, een De-Bruijn-grafiekgebaseerde benadering om de inserties af te leiden, een affiene-match affiene-gap lokale uitlijningstool om de locaties van die inserties te schatten en een Bayesiaans schattingskader voor SNP's.Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/refasp/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
