Dit is de Linux-app genaamd PPIXpress waarvan de laatste release kan worden gedownload als PPIXpress_1.23.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app genaamd PPIXpress met OnWorks gratis online.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
PPIXdruk
PRODUCTBESCHRIJVING
Hoewel eiwit-eiwit-interactienetwerken een alomtegenwoordig onderdeel zijn van de moderne systeembiologie, zijn er relatief weinig inspanningen gedaan om hun topologie aan te passen aan de feitelijke cellulaire toestand die wordt bestudeerd. Omdat een eenvoudige reductie van de netwerken tot de subset van tot expressie gebrachte genen alleen de regulerende capaciteiten van hogere organismen beschadigt, stellen we de geavanceerde methode PPIXpress voor die het mogelijk maakt om expressiegegevens op transcriptniveau te exploiteren en dus ook veranderingen in eiwitconnectiviteit veroorzaakt door alternatieve splicing.
De originele publicatie is te vinden op: https://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/4/571 .
Voordelen
- automatische constructie van eiwit-eiwit interactienetwerken
Toehoorders
Gezondheidszorgindustrie, Wetenschap/Onderzoek
Gebruikersinterface
Java Swing, Console/Terminal, Opdrachtregel
Programmeertaal
Java
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/ppixpress/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.