Dit is de Linux-app met de naam PSOVina 2.0 waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als POSE_PREDICTION.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam PSOVina 2.0 gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
PSOVina 2.0
PRODUCTBESCHRIJVING
Een snelle dockingtool gebaseerd op het efficiënte optimalisatie-algoritme van Particle Swarm Intelligence en het framework van AutoDock Vina. Op basis van de initiële PSO-implementatie heeft onze PSOVina-methode verschillende belangrijke verbeteringen ondergaan om de dockingaccuary te verbeteren en opmerkelijke efficiëntie te bereiken in vergelijking met de originele AutoDock Vina.Voordelen
- Veel sneller dan AutoDock Vina met betere of vergelijkbare nauwkeurigheid
- Geschikt voor eiwit-ligand docking en virtuele screening
- Nieuwste versie PSOVina-2.0 integreert de chaotische functie van Singer in globaal zoeken en efficiënte 2-trapsmethode in lokaal zoeken
- Bereik 6-7x sneller dan Vina
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/psovina/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.