Dit is de Linux-app genaamd RUbioSeq waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als RUbioSeq3.8.1.tgz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd RUbioSeq gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
RUbioSeq
PRODUCTBESCHRIJVING
De toenemende vraag naar next-generation sequencing (NGS)-onderzoeken heeft de noodzaak van geïntegreerde en betrouwbare pijplijnen opgemerkt om deep-sequencing-experimenten op een efficiënte manier te analyseren. We presenteren RUbioSeq+, een stand-alone en multiplatform-applicatie voor de geïntegreerde analyse van NGS-gegevens. Meer specifiek implementeert onze software pijplijnen voor de analyse van enkele nucleotide- en kopie-nummervariatie, bisulfite-seq en ChIP-seq-experimenten met behulp van gevestigde tools om deze algemene taken uit te voeren. RUbioSeq+ is gratis en bevat alle kernfunctionaliteiten die zijn geïmplementeerd in de oorspronkelijke release van RUbioSeq (v3.2.1), maar presteert ook beter dan de RUbioSeq-mogelijkheden en breidt deze uit, ter ondersteuning van de parallelle analyse van volledige genomen in computerfarms. RUbioSeq+ bevat ook een nieuwe GUI die is ontworpen voor interdisciplinaire onderzoeksgroepen waar bio-informatici en biomedische onderzoekers samenwerken.
Programmeertaal
Perl
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/rubioseq/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
