Dit is de Linux-app genaamd SOAPdenovo2 waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als SOAPdenovo2-src-r240.tgz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam SOAPdenovo2 gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SOAPdenovo2
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Wat biedt de toekomst van SOAPdenovo2:
MEGAHIT is de formele opvolger van SOAPdenovo2
MEGAHIT: een ultrasnelle single-node-oplossing voor grote en complexe metagenomics-assemblage via beknopte de Bruijn-grafiek
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
Nieuwste code op GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo is een nieuwe short-read assemblagemethode die een de novo concept-assemblage kan bouwen voor menselijke genomen. Het programma is speciaal ontworpen om Illumina short reads samen te stellen. Het creëert nieuwe mogelijkheden voor het bouwen van referentiesequenties en het uitvoeren van nauwkeurige analyses van onontgonnen genomen op een kosteneffectieve manier. SOAPdenovo2 is de opvolger van SOAPdenovo. Citeer het artikel gepubliceerd in GigaScience (zie onderstaande website) als u SOAPdenovo2 wilt citeren.
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, ontwikkelaars
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
C++, C
Database-omgeving
Plat bestand
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.