Dit is de Linux-app genaamd SSC waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als SSC0.1.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam SSC gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SSC
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
SSC is een hulpmiddel voor het voorspellen van de sgRNA-efficiëntie van spacersequenties. Het ondersteunt de toepassingen van het optimaliseren van sgRNA-bibliotheken in CRISPR/Cas9 knock-out- of CRISPR/dCas9-remmings-/activeringsschermen.Voordelen
- Kandidaat spacer-reeksen extraheren uit het .fasta-bestand
- Voorspel de sgRNA-efficiëntie van de spacersequenties, voor bibliotheekontwerp in CRISPR/Cas9-knock-out en CRISPR/dCas9-remming of -activering.
- bieden matrices die ondersteuning bieden voor: 19-20 bps spacers in CRISPR/Cas9 knock-out, geoptimaliseerd voor het genoom van mens en muis.
- bieden matrices die ondersteuning bieden voor: 19-21 bps spacers in CRISPR/dCas9, geoptimaliseerd voor menselijk genoom.
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/spacerscoringcrispr/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.