Dit is de Linux-app genaamd SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster om online in Linux te draaien, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer online deze app uit met de naam SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SWAPHI-LS: Uitlijning op Xeon Phi Cluster om online onder Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Het eerste parallelle Smith-Waterman-algoritme dat gebruik maakt van Intel Xeon Phi-clusters om de uitlijning van lange DNA-sequenties te versnellen. Dit algoritme is geschreven in C++ (met een set SIMD-intrinsieke extensies), OpenMP en MPI. Uit de prestatie-evaluatie bleek dat ons algoritme zeer stabiele prestaties behaalt, en een prestatie levert van maximaal 30.1 GCUPS op een enkele Xeon Phi en tot 111.4 GCUPS op vier Xeon Phis die een host delen.Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Console/Terminal, Opdrachtregel
Programmeertaal
C + +
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
