Dit is de Linux-app genaamd SWAPHI: Smith-Waterman op Intel Xeon Phi, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als swaphi-v1.0.5.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam SWAPHI: Smith-Waterman gratis uit op Intel Xeon Phi met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SWAPHI: Smith-Waterman op Intel Xeon Phi
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Het eerste parallelle algoritme om het zoeken naar Smith-Waterman-eiwitdatabases op meerdere Intel Xeon Phi-coprocessors met gedeelde host te versnellen. Door te zoeken in de UniProtKB/TrEMBL-database bereikt SWAPHI een prestatie van maximaal 58.8 miljard celupdates per seconde (GCUPS) op een enkele Xeon Phi en tot 228.4 GCUPS op vier Xeon Phi's.
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, onderwijs, techniek
Gebruikersinterface
.NET/Mono, Console/Terminal
Programmeertaal
C++, ALGOL68
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/swaphi/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.