Dit is de Windows-app genaamd Calis-p waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als Calisp-2.1.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd Calis-p gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
Calis-p
PRODUCTBESCHRIJVING
Calis-p (The CALgary approach to ISotopes in proteomics) is een Java-applicatie om de isotopensamenstelling (bijv. delta13C of delta15N) van individuele soorten in een microbiële gemeenschap te schatten op basis van een proteomische dataset. Calis-p 2.0 verwerkt zowel natuurlijke isotopenabundanties als gegevens van labelexperimenten zoals stabiele isotopenonderzoek (SIP). Het vereist een mzIdent (of doelspectrummatch) en mzML-bestanden als invoer en vereist ongeveer 1 minuut per mzML-bestand met 10 threads en heeft <10 Gb RAM nodig. Het is getest met gegevens van verschillende nano-vloeistofchromatografie/Orbitrap-platforms. Voor succesvolle SIP is het uiterst gevoelig, maar vereist dat de 13C-fractie onder de 10% blijft.
Deze software wordt niet langer onderhouden. Gebruik in plaats daarvan de nieuwere versie van Python: https://github.com/kinestetika/Calisp
Voordelen
- delta13C wordt geschat op basis van een standaard metaproteomische dataset
- Verkrijg op efficiënte en betrouwbare wijze delta13C voor veel soorten in microbioommonsters.
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/calis-p/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
