Dit is de Windows-app genaamd MCPerm: Monte Carlo SNP-permutatie om online in Windows te draaien via Linux. De nieuwste versie kan worden gedownload als MCPerm_1.1.2.tar.gz. Deze kan online worden uitgevoerd via de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer online deze app met de naam MCPerm: Monte Carlo SNP-permutatie uit om deze online in Windows via Linux online met OnWorks gratis uit te voeren.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
MCPerm: Monte Carlo SNP-permutatie om online in Windows via online Linux uit te voeren
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
MCPerm: een Monte Carlo-permutatiemethode voor meervoudige testcorrelatie in case-control associatieonderzoekTraditionele permutatietest (TradPerm) is een belangrijke niet-parametrische analysemethode die kan worden behandeld als de gouden standaard voor meerdere testcorrecties in case-control associatieonderzoek. Het is echter afhankelijk van de oorspronkelijke gegevens over genotypen en fenotypes van het enkelvoudige nucleotide polymorfisme (SNP) om een groot aantal willekeurige shuffles uit te voeren, en daarom is het rekenintensief, vooral voor genoombrede associatiestudie (GWAS). Om de rekensnelheid te verbeteren zonder de grootte van de TradPerm p-waarde te veranderen, hebben we een Monte Carlo permutatie (MCPerm) methode ontwikkeld als een efficiënt alternatief voor TradPerm.
Methoden: MCPerm hoeft de oorspronkelijke genotypen en fenotypegegevens niet in willekeurige volgorde te veranderen. Het maakt gebruik van de Monte Carlo-methode, maakt gebruik van hypergeometrische verdeling in twee stappen om het willekeurige aantal genotypen (AA, Aa en aa) in gevallen en controles te genereren.
Programmeertaal
S / R
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/mcperm/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
