Dit is de Windows-app genaamd Pysimony die in Windows online via Linux online moet worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als Pysimony.py. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam Pysimony online uit om gratis in Windows online via Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
Pysimony wordt online in Windows via Linux online uitgevoerd
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
UPDATE: Na enkele bugfixes heb ik Pysimony voor Javamony gedumpt: https://sourceforge.net/projects/javamony/Gezien de schoonheid van Python weet ik dat ik op een dag Pysimony zal moeten afmaken.
De eerste poging van een student tot een fylogenetisch inferentieprogramma, geschreven in het simplistische maar elegante Python.
Pysimony leest een FASTA-bestand (alleen ATGC geaccepteerd) dat als enige argument is opgegeven. Basistesten hebben aangetoond dat het traag, onnauwkeurig en absoluut inefficiënt is. Een waarschijnlijk niet de meest spaarzame boom wordt na voltooiing afgedrukt in het standaard Newick-boomformaat.
Omdat alle delen van het programma het originele werk zijn van een beginnende programmeur, kan dit een van de slechtste benaderingen zijn om het fylogenetische probleem op te lossen. Ik heb duidelijk objectgeoriënteerd programmeren vermeden.
Niettemin verspreid ik dit in de veronderstelling dat het ooit een beetje leerzaam zou kunnen zijn, of op zijn minst zou kunnen lachen om de zielige poging die het doet om het wiel opnieuw uit te vinden.
Kenmerken
- Gebrekkige spaarzaamheidscalculator
- Leest FASTA-bestanden (alleen ATGC)
- Voert een boom uit in Newick-indeling
- Eenvoudige, enkele modus
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, onderwijs
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/pysimony/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.