To jest polecenie arden-analyze, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
arden-analyze - analizuje wyniki mapowania sztucznego genomu referencyjnego
STRESZCZENIE
arden-analizować [Opcje] [WEJŚCIE FILE] [FOLDER WYJŚCIOWY] ...
OPIS
Skrypt do analizy wyników mapowania sztucznego genomu referencyjnego. Ten skrypt
identyfikuje domniemane TP / FP na określonym zbiorze danych (odczyty).
OPCJE
FOLDER WYJŚCIOWY
ścieżka do wyjściowego folderu docelowego.
WEJŚCIE FILE
pścieżka do pliku ini. Aby uzyskać wymagany format, przejrzyj przykładowe pliki.
--wersja
pokaż numer wersji programu i wyjdź
-h, --help
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
-p PHRED, --fred=FRED
Określ kodowanie PHRED odczytów wejściowych, np. Illumina 1.3+ = -p 33.[domyślnie:
33]
-r RANGA, --wewnętrzna ranga=RANGA
Użyj wewnętrznego rankingu dla odczytów (potrzebne, jeśli nazwy odczytów nie mogą być
leksykograficznie posortowane w ten sam sposób w pythonie i twoim systemie operacyjnym przez sam
narzędzia).[domyślnie:1]
Korzystaj z arden-analyze online, korzystając z usług onworks.net
