To jest polecenie bp_run_protdist.plp, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
run_neighbor - uruchom program „protdist” Phylipa przez Bioperl
STRESZCZENIE
run_protdist [-i plik wejściowy] [-o nazwa pliku wyjściowego]
OPIS
Podaj plik wyrównania do uruchomienia programu protdist. Plik powinien mieć nazwę .aln lub .phy.
Jest to wymagane, abyśmy mogli określić, czy musimy przekonwertować wyrównanie clustalw na
Filipa. Zapraszamy do rozszerzenia skryptu o pracę na innych formatach MSA, które bioperl
obsługuje. Jest to przeznaczone do stosowania w bardzo prostych ręcznych rurociągach.
Plik wejściowy powinien mieć nazwę w postaci plik.phy lub plik.aln program oczekuje a
plik w postaci (\S+)\.(\S+).
Spowoduje to uruchomienie aplikacji „protdist” przy użyciu formuły „KIMURA” do zbudowania białka
macierz odległości. Osoby z phylip3.6 będą chciały wprowadzić pewne zmiany, jeśli chcą używać
JTT. Chętnie pomogę dodać to jako argument cmd-line, jeśli jest to wymagane.
Korzystaj z bp_run_protdist.plp online korzystając z usług onworks.net
