Jest to polecenie bp_seqpartp, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
bp_seqpart.pl - Pobiera jeden lub więcej plików sekwencji i dzieli je na pewną liczbę ładunków
zrównoważone pliki.
ZASTOSOWANIE
bp_seqpart.pl -n [-h, -str , -F , -o ]
-n liczba plików do utworzenia poprzez partycjonowanie
-h ten komunikat pomocy
-p przedrostek dla wszystkich wyjściowych nazw plików FASTA, pliki mają postać / #.
-f format plików, domyślnie FASTA, ale możesz określić dowolny obsługiwany przez SeqIO z BioPerl
-o katalog wyjściowy, w którym należy zrzucić pliki podzielonej sekwencji
OPIS
Zawijanie skryptów SeqIO, które umożliwia partycjonowanie wielu plików sekwencji na prawie równe części
wielkości części do późniejszej obróbki równoległej. Nawet jeśli masz 10 plików wejściowych, do których wysyłasz dane wyjściowe
10 plików zrównoważy pliki tak, aby zawierały podobną całkowitą długość sekwencji. Identyfikatory są
ignorowane przy podejmowaniu decyzji o sposobie zrównoważenia każdej sekwencji.
Użyj bp_seqpartp online, korzystając z usług onworks.net
