Jest to polecenie cmtk-asegment_sri24, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
asegment_sri24 - Segmentacja przy użyciu atlasu SRI24
STRESZCZENIE
asegment_sri24 Obraz docelowy Obraz wyjściowy
OPIS
Następnie zarejestruj obraz docelowy w wybranym kanale atlasu ludzkiego mózgu SRI24
sformatuj jedną z map etykiet atlasu do obrazu docelowego. Uwaga: zakłada się, że
docelowy obraz jest pozbawiony czaszki, tj. zawiera tylko mózg.
OPCJE
Globalne Toolkit Opcje (te jest shared by cała kolekcja CMTK narzędzia)
--help
Zapisz listę podstawowych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.
--Pomóż wszystkim
Napisz pełną listę podstawowych i zaawansowanych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.
--wiki
Zapisz listę opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście w znacznikach MediaWiki.
--facet
Zapisz źródło strony podręcznika w znaczniku 'nroff' na standardowe wyjście.
--xml
Napisz specyfikację składni wiersza poleceń w znacznikach XML (w celu integracji z Slicerem).
--wersja
Zapisz wersję zestawu narzędzi na standardowe wyjście.
--Echo
Zapisz bieżącą linię poleceń na standardowe wyjście.
--pełny-poziom
Ustaw poziom szczegółowości.
--gadatliwy, -v
Zwiększ poziom szczegółowości o 1 (przestarzałe; obsługiwane w celu zapewnienia zgodności z poprzednimi wersjami).
--wątki
Ustaw maksymalną liczbę równoległych wątków (dla wątków POSIX i OpenMP).
Główny Opcje
--szybki, -f
Szybki tryb.
--rejestracja-kanał
Kanał SRI24 używany do rejestracji do obrazu docelowego. Obsługiwane wartości:
„spgr”, „early-fse”, „late-fse”, „fa”, gdzie wartością domyślną jest „spgr” lub użyj jednego z
Następujące:
--spgr
Kanał strukturalny SPGR (ważony T1). [To is dotychczasowy domyślny]
--wczesny-fse
Kanał szybkiego echa wirowego wczesnego echa (ważony PD).
--późno-fse
Kanał echa szybkiego wirowania z późnym echem (ważony T2).
--fa Ułamkowy kanał anizotropii uzyskany z obrazów tensora dyfuzji
--mapa etykiet
Mapa etykiety SRI24 przeformatowana do obrazu docelowego. Obsługiwane wartości:
„tzo116plus”, „lpba40”, „tkanka”, gdzie wartością domyślną jest „tzo116plus” lub użyj jednego z
następujące brzmienie:
--tzo116plus
Rozszerzony szablon parcelacji korowej oparty na regionie Tzourio-Mazoyer AAL 116
szablon. [To is dotychczasowy domyślny]
--lpba40
Szablon oparty na 40 tematach segmentacji probabilistycznego atlasu mózgu LONI.
--tkanka
Segmentacja tkanki z trzema przedziałami (GM, WM, CSF) z maksymalnym prawdopodobieństwem SRI24
mapa
AUTORSKI
Torsten Rohlfing, z udziałem Michaela P. Hasaka, Grega Jefferisa, Calvina R.
Maurer, Daniel B. Russakoff i Jarosław Halchenko
Użyj cmtk-asegment_sri24 online, korzystając z usług onworks.net
