cmtk-reformatx - Online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

reformatx - Przeformatowanie objętości

STRESZCZENIE

reformatx [opcje] --floating floatingImg cel x0 [x1 ...]
OR przeformatujx [opcje] cel [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
OR GDZIE x0 ... xN i xx0 ... xxN to [{-i,--odwrotność}] transformacja##. (Jeśli pierwszy
transformacja w ciągu jest odwrócona, wtedy '--inverse' musi być poprzedzone '--',
tj. użyj '-- --odwróć xform.path').

OPIS

Rozszerzone narzędzie do reformatowania objętości do obliczania przeformatowanych obrazów i map jakobianu z
dowolne sekwencje połączonych przekształceń

OPCJE

Globalne Toolkit Opcje (te jest shared by cała kolekcja CMTK narzędzia)
--help
Zapisz listę podstawowych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.

--Pomóż wszystkim
Napisz pełną listę podstawowych i zaawansowanych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.

--wiki
Zapisz listę opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście w znacznikach MediaWiki.

--facet
Zapisz źródło strony podręcznika w znaczniku 'nroff' na standardowe wyjście.

--wersja
Zapisz wersję zestawu narzędzi na standardowe wyjście.

--Echo
Zapisz bieżącą linię poleceń na standardowe wyjście.

--pełny-poziom
Ustaw poziom szczegółowości.

--gadatliwy, -v
Zwiększ poziom szczegółowości o 1 (przestarzałe; obsługiwane w celu zapewnienia zgodności z poprzednimi wersjami).

--wątki
Ustaw maksymalną liczbę równoległych wątków (dla wątków POSIX i OpenMP).

--Typ wyjścia
Skalarny typ danych dla obrazu wyjściowego. Obsługiwane wartości: "char", "byte", "short",
„ushort”, „int”, „uint”, „float”, „double” lub użyj jednego z poniższych:

--zwęglać
8 bitów, sygnowany

--bajt
8 bitów, bez znaku

--niski
16 bitów, sygnowany

--skrót
16 bitów, bez znaku

--int
32 bity podpisane

--uint
32 bity bez znaku

--pływak
32 bity zmiennoprzecinkowe

--podwójnie
64 bity zmiennoprzecinkowe

--wypełnienie , -P
Wartość dopełnienia obrazu wyjściowego [Domyślny: 0]

Opcje dla Równina Reformatowanie
--interpolacja
Metoda interpolacji obrazu. Obsługiwane wartości: "linear", "nn", "cubic", "pv", "sinc-
cosinus”, „sinc-hamming”, gdzie wartością domyślną jest „liniowy”, lub użyj jednego z poniższych:

--liniowy
Interpolacja trójliniowa [To is dotychczasowy domyślny]

--nn Interpolacja najbliższego sąsiada

--sześcienny
Interpolacja trójsześcienna

--str Interpolacja częściowej objętości

--sinc-cosinus
Interpolacja sinc z oknem cosinus

--Sinc-Hamming
Interpolacja Sinc z oknem Hamminga

--sinc-promień-okna
Promień okna dla interpolacji Sinc [Domyślny: 3]

--zachowaj-masę
Przeformatowanie z zachowaniem masy: pomnóż każdą przeformatowaną wartość przez jakobian
wyznacznik zastosowanej transformacji.

Opcje dla Jakobian Mapa Reformatowanie
--jacobian-poprawna-globalna
Popraw mapy Jakobian dla skali globalnej.

--no-jacobian-poprawny-global
Nie poprawiaj map jakobianu dla skali globalnej. [To is dotychczasowy domyślny]

Wkład Opcje
--siatka-docelowa
Zdefiniuj siatkę docelową do przekształcenia jako Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(wymiary:piksel:przesunięcie)

--maska, -m
Użyj danych pikseli docelowych jako maski binarnej.

--przyciąć
Przytnij obraz docelowy: x0,y0,z0,x1,y1,z2

--przesunięcie docelowe , -O
Zastąp przesunięcie obrazu docelowego i ustaw na x,y,z mm

--target-offset-piksele
Zastąp przesunięcie obrazu docelowego i ustaw piksele dx, dy, dz

--Ruchomy , -F
Format i ścieżka ruchomego obrazu. [Domyślny: ŻADEN]

--pad-pływający
Wartość dopełnienia dla pływającego obrazu [Domyślny: wyłączone]

Wydajność Opcje
--plik wyjściowy , -o
Format i ścieżka obrazu wyjściowego. [Domyślny: przeformatuj.nii ]

Obraz/Transformacja Baza danych
--db.
Ścieżka do bazy obrazów/transformacji, którą należy zaktualizować o nowo utworzoną
obraz. [Domyślny: ŻADEN]

AUTORSKI

Torsten Rohlfing, z udziałem Michaela P. Hasaka, Grega Jefferisa, Calvina R.
Maurer, Daniel B. Russakoff i Jarosław Halchenko

Użyj cmtk-reformatx online za pomocą usług onworks.net