cmtk-unwarp_image_phantom - Online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

unwarp_image_phantom - Utwórz transformację, aby rozpakować obraz oparty na fantomie
opis

STRESZCZENIE

unwarp_image_phantom WejściePhantom WejścieObraz WyjścieXform

OPIS

To narzędzie oblicza transformację wielomianową lub deformację swobodną B-splajn
rozpakuj obraz. Transformacja opiera się na oczekiwanych i wykrytych punktach orientacyjnych w
obraz fantomu strukturalnego uzyskany za pomocą tego samego skanera. Użyj „detect_adni_phantom”
narzędzie do wykrywania punktów orientacyjnych fantomu ADNI na obrazie i generowania fantomu
plik opisu odpowiedni do użycia z tym narzędziem.

OPCJE

Globalne Toolkit Opcje (te jest shared by cała kolekcja CMTK narzędzia)
--help
Zapisz listę podstawowych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.

--Pomóż wszystkim
Napisz pełną listę podstawowych i zaawansowanych opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście.

--wiki
Zapisz listę opcji wiersza poleceń na standardowe wyjście w znacznikach MediaWiki.

--facet
Zapisz źródło strony podręcznika w znaczniku 'nroff' na standardowe wyjście.

--wersja
Zapisz wersję zestawu narzędzi na standardowe wyjście.

--Echo
Zapisz bieżącą linię poleceń na standardowe wyjście.

--pełny-poziom
Ustaw poziom szczegółowości.

--gadatliwy, -v
Zwiększ poziom szczegółowości o 1 (przestarzałe; obsługiwane w celu zapewnienia zgodności z poprzednimi wersjami).

--wątki
Ustaw maksymalną liczbę równoległych wątków (dla wątków POSIX i OpenMP).

Dopasowywanie Opcje
--dopasowanie-odwrotne
Dopasuj transformację odwrotną (mapowanie rzeczywistych i oczekiwanych lokalizacji punktów orientacyjnych). To jest
przydatne do obliczania jakobianowej mapy korekcji objętości (przy użyciu „reformatx”) bez
konieczność numerycznego odwracania dopasowanej transformacji unwarping.

--dostosowany
Transformacja Fit Forward (oczekiwane mapowanie na rzeczywiste lokalizacje punktów orientacyjnych). To jest
przydatne do poprawiania obrazu poprzez ponowne wycinanie (przy użyciu „reformatx”). [To is dotychczasowy
domyślny]

Transformacja modele
--klin
Dopasuj odkształcenie swobodne typu B-spline.

--poli
Dopasuj transformację wielomianową. [To is dotychczasowy domyślny]

Wielomian Dopasowywanie Opcje (z --poli)
--stopień
Stopień dopasowanej transformacji wielomianu. [Domyślny: 4]

B-splajn Dopasowywanie Opcje (z --klin)
--final-cp-odstęp
Końcowy odstęp siatki punktów kontrolnych wyjściowej transformacji B-sklejanej. [Domyślny: 0]

--final-cp-dims
Ostateczne wymiary siatki punktów kontrolnych (tj. liczba punktów kontrolnych) wyjścia B-
transformacja splajnu. Należy podać jako „dimX, dimY, dimZ”. [Domyślny: ŻADEN]

--poziomy
Liczba poziomów w procedurze wielopoziomowej aproksymacji B-sklejanej. [Domyślny: 1]

--iteracje na poziomie
Maksymalna liczba iteracji aktualizacji współczynników splajnu na poziom w trybie wielopoziomowym
Procedura aproksymacji B-sklejanej. [Domyślny: 100]

--próg-rms
Próg względnej poprawy pozostałości dopasowania RMS. Odpowiednia iteracja
kończy się, jeśli (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate)/rmsBeforeUpdate < próg.
[Domyślny: 0]

--nie pasuje
Wyłącz dopasowanie transformacji afinicznej, aby zainicjować splajn. Zamiast tego dopasuj splajn
bezpośrednio. Zwykle daje to gorsze rezultaty i jest odradzane.

AUTORSKI

Torsten Rohlfing, z udziałem Michaela P. Hasaka, Grega Jefferisa, Calvina R.
Maurer, Daniel B. Russakoff i Jarosław Halchenko

Użyj cmtk-unwarp_image_phantom online, korzystając z usług onworks.net