Jest to polecenie edialigne, które można uruchomić w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
edialign - Lokalne wielokrotne dopasowanie sekwencji
STRESZCZENIE
wyrównać -sekwencje sekwencja -tryb nuklearny podstęp -obr.komp boolean [-nakładanie się wybór]
[-połączenie podstęp] [-maxfragl liczba całkowita] -fragmat boolean -fragment liczba całkowita
[-jego wynik boolean] [-próg unosić się] -maska boolean -dogwiazdy boolean
-gwiazda liczba całkowita -plik wyjściowy plik wyjściowy -nast kolejne
wyrównać -Pomoc
OPIS
wyrównać to program wiersza poleceń firmy EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Pakiet oprogramowania"). Jest częścią grupy poleceń „Wyrównanie: Wiele”.
OPCJE
Wkład Sekcja
-sekwencje sekwencja
Dodatkowy Sekcja
-tryb nuklearny podstęp
Tryb dopasowania sekwencji kwasu nukleinowego (prosty, przetłumaczony lub mieszany) Wartość domyślna: brak
-obr.komp boolean
Wartość domyślna: N
-nakładanie się wybór
Domyślnie wagi nakładania się są używane, gdy Nseq =<35, ale możesz ustawić tę opcję na „tak” lub
„nie” Wartość domyślna: domyślna (gdy Nseq =< 35)
-połączenie podstęp
Metoda grupowania w celu skonstruowania drzewa sekwencji (UPGMA, połączenie minimalne lub maksymalne
połączenie) Wartość domyślna: UPGMA
-maxfragl liczba całkowita
Wartość domyślna: 40
-fragmat boolean
Wartość domyślna: N
-fragment liczba całkowita
Wartość domyślna: 4
-jego wynik boolean
Wartość domyślna: N
-próg unosić się
Wartość domyślna: 0.0
Wydajność Sekcja
-maska boolean
Wartość domyślna: N
-dogwiazdy boolean
Wartość domyślna: N
-gwiazda liczba całkowita
Wartość domyślna: 4
-plik wyjściowy plik wyjściowy
-nast kolejne
Korzystaj z edialigne online, korzystając z usług onworks.net
