Jest to polecenie EDTSurf, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
EDTSurf - szybka i dokładna konstrukcja powierzchni makromolekularnych
STRESZCZENIE
EDTSurf -i nazwa_pdb...
OPIS
EDTSurf to program typu open source do konstruowania triangulowanych powierzchni makrocząsteczek. To
generuje trzy główne powierzchnie makromolekularne: powierzchnię van der Waalsa, dostępną dla rozpuszczalnika
powierzchnia i powierzchnia molekularna (powierzchnia pozbawiona rozpuszczalnika). EDTsurf identyfikuje również ubytki
które znajdują się wewnątrz makrocząsteczek.
OPCJE
-o wyprzedzić
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-czysty 2-atomowy 3-łańcuchowy
-p promień sondy [0,2.0]
-f współczynnik skali (0,20.0]
-h 1-wejście i wyjście 2-wyjście 3-wejście
wyjście 1: outname.ply
wyjście2: nazwa_wyjściowa.asa
wyjście 3: outname-cav.pdb
Korzystaj z EDTSurf online, korzystając z usług onworks.net
