Jest to polecenie fastaq-trim_contigs, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
fastaq_trim_contigs - Przycina określoną liczbę baz z końca każdego kontigu
OPIS
użycie: fastaq_trim_contigs [opcje]
Przycina określoną liczbę podstaw z końca każdego kontigu, dzięki czemu przerwy stają się większe i kontigi
końcówki są usuwane. Podstawy są zastępowane przez Ns. Każda sekwencja, która kończy się jako wszystkie N, jest tracona
pozycyjny argumenty:
infile Nazwa pliku wejściowego
plik wyjściowy
Nazwa pliku wyjściowego
fakultatywny argumenty:
-h, --help
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
--numer_przycięcia TRIM_NUMBER
Liczba zasad do przycięcia wokół każdej przerwy i poza końcami każdej sekwencji [100]
Korzystaj z fastaq-trim_contigs online, korzystając z usług onworks.net
