To jest polecenie fdnadiste, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych internetowych stacji roboczych, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
fdnadist - Program do tworzenia sekwencji kwasów nukleinowych Distance Matrix
STRESZCZENIE
fdnadysta -sekwencja seqsetall -metoda podstęp -gamma podstęp -nkategorie liczba całkowita -oceniać szyk
-kategorie niska zabudowa [-ciężary niska zabudowa] -współczynnik gamma unosić się
-invarfrac unosić się -tratio unosić się -częstości z przełącznik -częst.podst szyk
[-niższy boolean] [-czytelny dla człowieka boolean] -plik wyjściowy plik wyjściowy [-wydrukuj dane boolean]
[-postęp boolean]
fdnadysta -Pomoc
OPIS
fdnadysta to program wiersza poleceń firmy EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Pakiet oprogramowania"). Jest częścią grupy poleceń „Filogeny:Molecular sequence”.
OPCJE
Wkład Sekcja
-sekwencja seqsetall
Plik zawierający jedno lub więcej dopasowań sekwencji
-metoda podstęp
Wartość domyślna: model odległości F84
-gamma podstęp
Wartość domyślna: nie użyto parametrów dystrybucji
-nkategorie liczba całkowita
Wartość domyślna: 1
-oceniać szyk
Wartość domyślna: 1.0
-kategorie niska zabudowa
Plik kategorii stopy substytucyjnej
-ciężary niska zabudowa
Dodatkowy Sekcja
-współczynnik gamma unosić się
Wartość domyślna: 1
-invarfrac unosić się
Wartość domyślna: 0.0
-tratio unosić się
Wartość domyślna: 2.0
-częstości z przełącznik
Wartość domyślna: Y
-częst.podst szyk
Wartość domyślna: 0.25 0.25 0.25 0.25
-niższy boolean
Wartość domyślna: N
-czytelny dla człowieka boolean
Wartość domyślna: @($(metoda)==s?Y:N)
Wydajność Sekcja
-plik wyjściowy plik wyjściowy
-wydrukuj dane boolean
Wartość domyślna: N
-postęp boolean
Wartość domyślna: Y
Korzystaj z fdnadiste online za pomocą usług onworks.net
