Jest to polecenie geneparse-mpi, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
geneparse - frontend do ładowania plików sekwencji
SYNAPSA
geneparse [opcje...] [wejście] [wejście2...] #odczytaj wejście i zapisz na standardowe wyjście
OPIS
Czyta plik sekwencji i zapisuje go gdzieś (domyślnie na standardowe wyjście).
Określony zakres w pliku wejściowym może być określony przez plik[start,stop]. Plac
nawiasy można zamienić na dowolne z {[()]}, (np. "genome.fa[3000,4000]" lub
"genome.fa{3000~4000}"). Pamiętaj, że wszystkie te elementy mogą zostać przeanalizowane przez twoją powłokę. Także
do oddzielenia liczb można użyć dowolnego znaku niebędącego słowem.
OPCJE
--powtórz maskę|-r
użyj miękkich sekwencji z maską powtórzeń (np. zamień małe litery na N).
--górny|--unmask|-U
wielkimi literami wszystkie zasady.
--długość|-l
po prostu wydrukuj długość i wyjdź
--czyste|-c
nie dodawaj nowej linii po zakończeniu
--wersja|-V
wyświetla wersję programu
--pomoc|-h
drukuje wiadomość pomocy
--wyjście|-o
wyślij dane wyjściowe do pliku (w przeciwnym razie użyj stdout). --wyjście implikuje --clean.
--cichy|-q
uciszyć wszystkie ostrzeżenia
--verbose|-v
drukuje wiele dodatkowych szczegółów
Korzystaj z geneparse-mpi online za pomocą usług onworks.net
