Jest to polecenie hmm2fetch, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
hmm2fetch - pobierz HMM z bazy danych HMM
STRESZCZENIE
hmm2pobierz [opcje] baza danych Nazwa
OPIS
hmm2pobierz to małe narzędzie, które pobiera HMM o nazwie Nazwa z bazy danych modeli HMMER
nazywa Baza danych. w nowym formacie i drukuje ten model na standardowym wyjściu. Na przykład,
hmm2pobierz Pfam Rrm pobiera model RRM (motyw rozpoznawania RNA) z Pfam, jeśli
zmienna środowiskowa HMMERDB jest ustawiona na lokalizację bazy danych Pfam. Odzyskane
Plik HMM jest zapisany w formacie HMMER 2 ASCII.
Z bazą danych musi być powiązany plik indeksu GSI. Aby zaindeksować bazę danych HMM, użyj metody
program hmm2indeks.
OPCJE
-h Wydrukuj krótką pomoc; zawiera numer wersji i podsumowanie wszystkich opcji, w tym
opcje eksperckie.
-n interpretator Nazwa jako numer HMM zamiast nazwy. Numeracja rozpoczyna się od 0. For
na przykład, aby pobrać pierwszy HMM z bazy danych HMM o nazwie bla, ty byś zrobił
hmm2pobierz -n 0 bla.
Użyj hmm2fetch online, korzystając z usług onworks.net
