Jest to polecenie last-split, które można uruchomić u bezpłatnego dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
last-split — szacuje wyrównania „podzielone” lub „połączone”.
STRESZCZENIE
ostatni podział [Opcje] OSTATNIE wyrównanie.maf
OPIS
Odczytaj dopasowania sekwencji zapytań do genomu i oszacuj źródło genomowe każdego z nich
część każdego zapytania, pozwalając różnym częściom jednego zapytania pochodzić z różnych części
genom.
OPCJE
-h, --help
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
-g, --genom=IMIĘ
nazwa genomu lastdb
-d, --kierunek=D
Kierunek RNA: 0=odwrotny, 1=do przodu, 2=mieszany (domyślnie=1)
-c, --cis=SONDA
prawdopodobieństwo splicingu cis na podstawę (domyślnie=0.004)
-t, --tłum=SONDA
prawdopodobieństwo trans-splicingu na bazę (domyślnie=1e-05)
-M, --mieć na myśli=MEAN
średnia z ln[długość intronu] (domyślnie=7)
-S, --sdew=ODCH
odchylenie standardowe ln[długość intronu] (domyślnie=1.7)
-m, --błędna mapa=SONDA
maksymalne prawdopodobieństwo błędnego odwzorowania (domyślnie = 0.01)
-s, --wynik=INT
minimalny wynik wyrównania (domyślnie=e LUB e+t*ln[1000])
-n, --Bez podziału
napisz oryginalne, nie podzielone wyrównania
-v, --gadatliwy
być gadatliwym
-V, --wersja
pokaż informacje o wersji i wyjdź
Korzystaj z ostatniego podziału online, korzystając z usług onworks.net
