To jest polecenie mia-2dmyocard-icaseries, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
mia-2dmyocard-icaseries — Przeprowadź analizę ICA na serii obrazów 2D
STRESZCZENIE
mia-2dmyocard-icaseries -i [opcje]
OPIS
mia-2dmyocard-icaseries Ten program służy do przeprowadzania ICA na serii mięśnia sercowego
obrazy perfuzji podane w zbiorze segmentacji w celu stworzenia syntetycznych odniesień, które
może być używany do korekcji ruchu poprzez rejestrację obrazu. Jeśli celem jest uruchomienie pełnego
kompensacja ruchu to lepiej uruchomić mia-2dmyoica-nonrigid, skoro ten program jest
zasadniczo to samo bez bitów rejestracyjnych.
OPCJE
Plik-IO
-i --in-file=(wejście, wymagane); strunowy
wprowadź zestaw danych perfuzji
-r --references=(wyjście); strunowy
Baza nazw plików dla obrazów referencyjnych. Typ obrazu i schemat numeracji to
pobierane z obrazów wejściowych.
-c --save-cropped=(wyjście); strunowy
zapisz przycięty zestaw oryginalnego zestawu do tego pliku, którego użyją pliki obrazów
rdzeń nazwy jako podstawa nazwy pliku
--save-feature=(wyjście); strunowy
zapisz obrazy funkcji wynikające z ICA i niektóre obrazy pośrednie
używany do segmentacji RV-LV z podanej bazy nazw plików do plików PNG.
Zapisz także współczynniki początkowego najlepszego i końcowego mieszania IC
matryca.
Pomoc & Informacia
-V --verbose=ostrzeżenie
gadatliwość wyjścia, komunikaty drukowane na danym poziomie i wyższych priorytetach.
Obsługiwane priorytety zaczynające się od najniższego poziomu to:
Informacje ‐ Komunikaty niskiego poziomu
wyśledzić ‐ Śledzenie wywołań funkcji
nie ‐ Zgłoś niepowodzenia testu
ostrzeżenie ‐ Ostrzeżenia
błąd ‐ Zgłoś błędy
debug ‐ Wyjście debugowania
wiadomość ‐ Normalne wiadomości
fatalny ‐ Zgłoś tylko błędy krytyczne
--prawa autorskie
drukuj informacje o prawach autorskich
-h --pomoc
wydrukuj tę pomoc
-? --stosowanie
wydrukuj krótką pomoc
--wersja
wydrukuj numer wersji i wyjdź
ICA
-C --komponenty=0
Komponenty ICA 0 = automatyczne oszacowanie Komponenty ICA 0 = automatyczne
kosztu projektu
--normalizować
znormalizowane układy scalone
--no-znacznik
nie usuwaj średniej z krzywych mieszania
-s --segscale=1.4
segmentuj i skaluj pole kadrowania wokół segmentu LV (0 = brak segmentacji) i
skaluj pole przycinania wokół LV (0 = brak segmentacji)
-k --pomiń=0
pomiń obrazy na początku serii, ponieważ są to inne
modalności pomijaj obrazy na początku serii, tak jak w przypadku innych
modalności
-m --max-ica-iter=400
maksymalna liczba iteracji w ICAmaksymalna liczba iteracji w ICA
-E --segmethod=funkcje
Metoda segmentacji
szczyt delta – różnica obrazów wzmocnienia pików
cechy – obrazy charakterystyczne
funkcja delta - różnica obrazów cech
Przetwarzanie
--wątki=-1
Maksymalna liczba wątków do wykorzystania do przetwarzania, ta liczba powinna być mniejsza
lub równa liczbie rdzeni procesora logicznego w maszynie. (-1:
automatyczne oszacowanie). Maksymalna liczba wątków do wykorzystania do przetwarzania, to
liczba powinna być mniejsza lub równa liczbie rdzeni procesora logicznego w
maszyna. (-1: estymacja automatyczna).
PRZYKŁAD
Oceń syntetyczne odniesienia z zestawu segment.set i zapisz je w refXXXX.??? przez
używając pięciu niezależnych komponentów i pomijając 2 obrazy. Domyślnie ramka ograniczająca
wokół LV zostaną podzielone na segmenty i przeskalowane o 1.4, a przycięte obrazy zostaną zapisane
uprawXXXX.??? i tworzony jest zestaw segmentacji cropped.set. Typ pliku obrazu ??? Jest
odjęta od obrazów wejściowych w segmencie.set.
mia-2dmyocard-icaseries -i segment.set -r ref -o ref -k 2 -C 5
Autorski)
Gerta Wollnego
PRAWA AUTORSKIE
To oprogramowanie jest objęte prawami autorskimi (c) 1999‐2015 Lipsk, Niemcy i Madryt, Hiszpania. Nadchodzi
bez ABSOLUTNIE ŻADNEJ GWARANCJI i możesz ją redystrybuować zgodnie z warunkami GNU
OGÓLNA LICENCJA PUBLICZNA W wersji 3 (lub nowszej). Aby uzyskać więcej informacji, uruchom program za pomocą
opcja '--prawa autorskie'.
Korzystaj z mia-2dmyocard-icaseries online, korzystając z usług onworks.net