To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie AmPEP i AxPEP, której najnowszą wersję można pobrać jako deep-ampep30-test_set.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie AmPEP i AxPEP z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
AmPEP i AxPEP
OPIS
Peptydy przeciwdrobnoustrojowe (AMP) są obiecującymi kandydatami w walce z patogenami wielolekoopornymi ze względu na szeroki zakres działania i niską toksyczność. Jednak identyfikacja AMP za pomocą eksperymentu w laboratorium mokrym jest nadal kosztowna i czasochłonna. AmPEP to dokładna metoda obliczeniowa do przewidywania AMP przy użyciu algorytmu lasu losowego. Model przewidywania opiera się na wzorcach rozkładu właściwości aminokwasów wzdłuż sekwencji. Nasz optymalny model, AmPEP ze stosunkiem danych 1:3, osiągnął bardzo wysoką dokładność 96%, MCC 0.9, AUC-ROC 0.99 i statystykę Kappa 0.9. AmPEP przewyższa istniejące metody pod względem dokładności, MCC i AUC-ROC podczas testowania przy użyciu zestawów danych porównawczych.Funkcjonalności
- Kod źródłowy MATLAB-a
- Zbiory danych AmPEP
- Nauczanie maszynowe
- Bioinformatyka
- Sekwencja peptydów
- Odkrycie narkotyków
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/axpep/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
