To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie BIGSdb, której najnowszą wersję można pobrać jako bigsdb_1.24.1.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie BIGSdb z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
BIGSdb
OPIS
Bacterial Isolate Genome Sequence Database (BIGSdb) to skalowalny, dostępny przez Internet system baz danych przeznaczony do przechowywania i analizowania powiązanych informacji fenotypowych i genotypowych w sposób wydajny obliczeniowo. Dane dotyczące sekwencji mogą wahać się od pojedynczych odczytów sekwencji do wielu kontigów generowanych przez technologie sekwencjonowania całego genomu. System obejmuje zdolność definiowania i identyfikowania dowolnej liczby loci i wariantów genetycznych w tych loci w przechowywanych sekwencjach nukleotydowych. Te loci można dalej organizować w schematy do charakteryzowania izolatów lub do analiz ewolucyjnych lub funkcjonalnych.Patrz Jolley i Maiden 2010, BMC Bioinformatics 11:595 (http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/595).
Możesz zgłaszać błędy lub zgłaszać prośby o ulepszenia za pomocą narzędzia do śledzenia problemów pod adresem https://github.com/kjolley/BIGSdb. Kod źródłowy jest tam również odzwierciedlony.
Publiczność
Nauka/badania, zaawansowani użytkownicy końcowi, programiści
Interfejs użytkownika
Oparte na sieci Web
Język programowania
Perla, JavaScript
Środowisko bazy danych
PostgreSQL (pgsql)
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/bigsdb/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
