Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie CoVEC, której najnowszą wersję można pobrać jako covec_distribution-v0.4.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie CoVEC z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
CoVEC
Ad
OPIS
Pakiet zawiera modele SVM do użycia z SVMlight (http://svmlight.joachims.org/) za wyciągnięcie konsensusu na podstawie indywidualnych prognoz osób trzecich dotyczących skutków mutacji. Narzędziami firm trzecich są SIFT, Polyphen3, SNPs&GO i Mutation Assessor.
Pakiet zawiera również szereg modułów i skryptów Perla pomagających w przygotowaniu danych. Moduły mogą służyć do budowania niestandardowych narzędzi i potoków, podczas gdy skrypty zapewniają podstawowe implementacje wykonywalne w oparciu o moduły.
SVMlight, SIFT, Polyphen2, SNPs&GO i Mutation Assessor są własnością ich autorów i instytucji i nie są rozpowszechniane w tym pakiecie.
Publiczność
Przemysł medyczny, nauka/badania, deweloperzy
Interfejs użytkownika
Konsola/Terminal, wiersz poleceń
Język programowania
Perl
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/covec/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.