To jest aplikacja Linux o nazwie CSBB-v3.0, której najnowszą wersję można pobrać jako CSBB-v3.0.zip. Można ją uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom bezpłatnie aplikację CSBB-v3.0 z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
CSBB-v3.0
Ad
OPIS
CSBB to oparty na linii poleceń pakiet bioinformatyczny do analizowania danych biologicznych uzyskanych za pomocą różnych metod eksperymentów biologicznych. CSBB jest zaimplementowany w Perlu, ale wykorzystuje również R, java, python i ruby w tle dla określonych modułów. Głównym celem CSBB jest umożliwienie użytkownikom ze społeczności biologii i bioinformatyki czerpania korzyści z wykonywania dalszych zadań analitycznych przy jednoczesnym wyeliminowaniu konieczności pisania kodu programistycznego. CSBB jest obecnie dostępny w systemach Linux, UNIX.Obecnie CSBB oferuje 18 modułów skoncentrowanych na zadaniach analitycznych, takich jak wykonywanie normalizacji górnego kwantyla, interaktywna wizualizacja i potoki sekwencjonowania nowej generacji. CSBB ma teraz również możliwość przetwarzania danych publicznych. Zapewnienie użytkownikowi kompleksowego doświadczenia potoku.
Funkcjonalności
- sekwencja RNA
- Chip-Seq
- Sekwencja ATAC
- Normalizacja
- Wyrażenie różnicowe
- Przetwarzanie danych publicznych
- Rurociągi od końca do końca
- open Source
- Wizualizacja
- Bioinformatyka
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
Perl
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
