To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie CUSHAW2: Parallel Gapped Read Alignment, której najnowszą wersję można pobrać jako cushaw2-v2.1.11.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie CUSHAW2: Parallel Gapped Read Alignment with OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
CUSHAW2: Równoległe wyrównanie odczytu z przerwami
Ad
OPIS
CUSHAW2 to szybkie i równoległe dopasowanie odczytu z przerwami do dużych genomów, takich jak ludzki genom. Ocena wydajności, polegająca na dopasowaniu symulowanych i rzeczywistych zestawów danych do ludzkiego genomu, pokazuje, że CUSHAW2 niezmiennie plasuje się wśród najwyżej ocenianych nakładek pod względem jakości wyrównania zarówno dla wyrównania pojedynczego, jak i sparowanego końca, wykazując przy tym wysoce konkurencyjną szybkość. Ponadto nasz aligner wykazuje dobrą skalowalność równoległą w odniesieniu do liczby wątków procesora.
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
C + +
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/cushaw2/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
