Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie FIAP, której najnowszą wersję można pobrać jako FIAP.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie FIAP z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
FIAP
Ad
OPIS
FIAP (Fully Integrated Annotation Pipeline) to szybki wielowątkowy potok adnotacji genomu bakteryjnego napisany w Perlu, który wykrywa geny kodujące białka, tRNA i rRNA (5S, 16S i 23S). FIAP pozwala również użytkownikom na uwzględnienie nieskończonej liczby niestandardowych baz danych. Ta funkcja jest niezwykle cenna, ponieważ pozwala użytkownikom dodać osobisty „smak” do adnotacji i zoptymalizować proces dla określonego genomu bakterii. FIAP może opisywać pojedyncze i wielokrotne sekwencje, co pozwala użytkownikom opisywać, na przykład, szkice kontigów genomu lub różne genomy połączone w pliku multi-fasta w jednym kroku.
FIAP działa na wszystkich systemach operacyjnych typu UNIX (testowane na Ubuntu 14.04 LTS i Mac OS 10.9.4).
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Konsola/Terminal
Język programowania
Perl
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/fiap/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
