To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie Hamstr, której najnowszą wersję można pobrać jako hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie Hamstr z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
Hamstr
Ad
OPIS
HaMStR przeniósł się do https://github.com/bionf/hamstr gdzie jest teraz częścią pakietu HaMStR-OneSeq.
HaMStR to narzędzie oparte na ukrytym profilu Markowa do ukierunkowanego wyszukiwania ortologów w danych EST lub sekwencji białek. Jako dane wejściowe program pobiera wstępnie zdefiniowaną grupę rdzeniową sekwencji ortologicznych (ortologów podstawowych) oraz zestaw sekwencji z taksonu wyszukiwania. Następnie HaMStR łączy w dwuetapowej strategii wyszukiwanie oparte na pHMM i wyszukiwanie odwrotne za pomocą BLAST, aby rozszerzyć podstawową grupę ortologów o nowe sekwencje z taksonu wyszukiwania.
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
Perl
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/hamstr/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
