Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie HMCan, której najnowszą wersję można pobrać jako HMCan.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie HMCan z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
HMCan
Ad
OPIS
HMCan to narzędzie oparte na ukrytym modelu Markowa, które zostało opracowane w celu wykrywania modyfikacji histonów w danych ChIP-seq raka. Stosuje trzy etapy korekcji danych: korekcję liczby kopii, korekcję odchylenia GC i korektę poziomu szumów.
Aby uruchomić HMCan, potrzebny jest plik wyrównania celu ChIP-seq i plik wyrównania sterowania. Wymagana jest również pewna konfiguracja, aby uzyskać więcej informacji, sprawdź plik README.
Autor: Haitham Ashur
Kontakt: Valentina Boeva Instytut Curie
Uniwersytet Naukowo-Technologiczny Haitham Ashoor Kinga Abdullaha.
Język programowania
C + +
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/hmcan/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.