Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie isiKnock do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako isiKnockv1.0.0.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie isiKnock, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
isiKnock do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
Szlaki sygnałowe to złożone i wzajemnie powiązane procesy. Zaburzenie systemów biologicznych może ujawnić skomplikowane wzajemne oddziaływanie i zależności składników szlaku.isiKnock to oprogramowanie do automatycznego przeprowadzania i wizualizacji nokautów in silico dla ścieżek sygnałowych (Hannig i in. 2019). isiKnock przewiduje zachowanie nokautu na podstawie obliczeń przepływów sygnału w stanie ustalonym. Aby uzyskać wyjaśnienie koncepcji nokautów in silico, odsyłamy do Scheidel et al. 2016 oraz Amstein i in. 2017.
Hanniga i in. (2019) isiKnock: nokaut in silico w szlakach sygnałowych, Bioinformatics, 35 (5), 892–894
Amstein i in. (2017) Niezmienniki manatów ujawniają funkcjonalne ścieżki w sieciach sygnalizacyjnych. Biologia systemów BMC, 11(1), 72.
Scheidela i in. (2016) Badania nokautowe in silico ksenofagicznego wychwytywania Salmonelli. Biologia obliczeniowa PLoS, 12(12), e1005200.
Korzyści
- Biologia systemów
- Nokaut in silico
- Perturbacje
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/molbi-isiknock/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
