To aplikacja linuksowa o nazwie MARAGAP, której najnowszą wersję można pobrać jako Data-Maragap.rar. Można ją uruchomić online na darmowym hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom bezpłatnie aplikację MARAGAP z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
MARAGAP
Ad
OPIS
W niniejszym artykule przedstawiono „MARAGAP”, proces składania genomu wspomagany referencyjnie. MARAGAP wykorzystuje zasadę minimalnej długości opisu (Minimum Description Length) do określenia optymalnej sekwencji referencyjnej do złożenia. Optymalna sekwencja referencyjna służy jako szablon do wnioskowania o inwersjach, insercjach, delecjach i SNP w genomie docelowym. MARAGAP wykorzystuje podejście algorytmiczne do wykrywania i korygowania inwersji i delecji, podejście oparte na grafie De-Bruijna do wnioskowania o insercjach, narzędzie lokalnego dopasowania afinicznego z luką afiniczną do szacowania lokalizacji tych insercji oraz bayesowskie ramy estymacji SNP.Tę aplikację można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/refasp/. Została ona umieszczona w OnWorks, aby można ją było uruchomić online w najłatwiejszy sposób z jednego z naszych darmowych systemów operacyjnych.
