Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie mCarts do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako mCarts.v1.2.0.tgz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie mCarts, aby bezpłatnie uruchomić Linuksa online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
mCarts do uruchomienia w Linuksie online
Ad
OPIS
Wiele RBP rozpoznaje bardzo krótkie i zdegenerowane sekwencje, a specyficzność ukierunkowania osiąga się dzięki mechanizmom, takim jak synergiczne wiązanie z wieloma zgrupowanymi miejscami i modulacja dostępności miejsca poprzez różne struktury drugorzędowe RNA. mCarts integruje liczbę i odstępy poszczególnych witryn motywów, ich dostępność i zachowanie, co znacznie poprawia stosunek sygnału do szumu. Algorytm ten uczy się i określa ilościowo zasady tych cech, wykorzystując dużą liczbę miejsc wiązania RBP in vivo uzyskanych z wysokoprzepustowego sekwencjonowania RNA izolowanych przez sieciowanie i immunoprecypitację (HITS-CLIP). Zastosowaliśmy ten algorytm do badania dwóch reprezentatywnych RBP, Nova i Mbnl. Pomimo bardzo małej zawartości informacji w poszczególnych elementach motywu, nasz algorytm wykonał bardzo szczegółowe prognozy dla pomyślnej walidacji eksperymentalnej.Publiczność
Nauka/badania, zaawansowani użytkownicy końcowi
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Perl
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/mcarts/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
