To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie MendelChecker, której najnowszą wersję można pobrać jako MendelChecker_v2.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie MendelChecker z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
MendelChecker
Ad
OPIS
MendelChecker jest opartą na prawdopodobieństwie miarą Mendla segregacji polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP) w rodowodach jądrowych. Opracowaliśmy tę metodę jako środek kontroli jakości dla odkrywania nowych wariantów na podstawie zaszumionych danych sekwencjonowania nowej generacji w rodowodach, takich jak sekwencjonowanie DNA powiązane z miejscem restrykcyjnym (RAD-seq) w organizmach niemodelowych. Metoda ta realizuje porównanie transmisji heterogametycznej i homogametycznej, tj. segregacji powiązanej z płcią i autosomalnej.
Korzyści
- Zmierz prawdopodobieństwo transmisji Mendla w rodowodach
- Przypisanie autosomu a przypisanie chromosomu płci
- Czyta standardowe wyjście GATK
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.