To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie MToolBox do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako MToolBox.v0.3.3.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie MToolBox, aby działać w systemie Linux online z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
MToolBox do pracy w systemie Linux online
Ad
OPIS
MToolBox to wysoce zautomatyzowany rurociąg bioinformatyczny do rekonstrukcji i analizy ludzkiego mitochondrialnego DNA na podstawie danych sekwencjonowania o wysokiej przepustowości. MToolBox zawiera zaktualizowaną strategię obliczeniową do składania genomów mitochondrialnych z całego egzomu i/lub sekwencjonowania genomu (PMID: 22669646) oraz ulepszone narzędzie do klasyfikacji fragmentów (PMID:22139932) do przypisywania haplogrup, analizy funkcjonalnej i priorytetyzacji wariantów mitochondrialnych. MToolBox zapewnia wyniki patogeniczności, profile zmienności genomu i powiązania chorób dla wariantów mitochondrialnych. MToolBox dostarcza również plik Variant Call Format (wersja 4.0) zawierający, po raz pierwszy, heteroplazmię specyficzną dla alleli.Proszę sprawdzić najnowsze aktualizacje kodu źródłowego z repozytorium Github MToolBox:
https://github.com/mitoNGS/MToolBox
lub odwiedź internetową wersję MToolBox @ MSeqDR:
https://mseqdr.org/mtoolbox.php
Język programowania
Powłoka uniksowa, Python
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/mtoolbox/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.