Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie PLEK, której najnowszą wersję można pobrać jako PLEK.1.2.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie PLEK z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
PLEK
Ad
OPIS
PORADYWarunek wstępny:
1.Linux
2. Kompilator C/C++ (np. gcc, g++)
3. Python 2.5.0 lub nowsze wersje (http://www.python.org/)
Kroki:
1. Pobierz PLEK.1.2.tar.gz z https://sourceforge.net/projects/plek/files/
i rozpakuj go.
$ tar zvxf PLEK.1.2.tar.gz
2. Skompiluj PLEK.
$ cd PLEK.1.2
$ Python PLEK_setup.py
ZASTOSOWANIE
python PLEK.py -fasta plik_fasta -out plik_wyjściowy - wątek liczba_wątków
-mindługość min_długość_sekwencji -isoutsg 0_lub_1 -isrmtempfile 0_lub_1
Przykłady:
1. $ python PLEK.py -fasta PLEK_test.fa -przewidywane wyjście - wątek 10
2. $ python PLEK.py -fasta PLEK_test.fa -out przewidywane -wątek 10 -minlength 150
=======================
dr Aimin Li
Wyższa Szkoła Informatyki i Inżynierii,
Politechnika Xi'an,
Droga Południowa Jinhua 5,
Xi'an, Shaanxi 710048, PR Chiny
liaiminmail AT gmail.com
emanlee815 AT 163.com
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/plek/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
