To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie PPIXpress, której najnowszą wersję można pobrać jako PPIXpress_1.23.zip. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie PPIXpress z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
PPIXnaciśnij
OPIS
Chociaż sieci interakcji białko-białko są wszechobecnym elementem współczesnej biologii systemów, podjęto stosunkowo niewiele wysiłków, aby dostosować ich topologię do rzeczywistego stanu badanej komórki. Ponieważ prosta redukcja sieci do podzbioru eksprymowanych genów jedynie zarysowuje powierzchnię zdolności regulacyjnych organizmów wyższych, proponujemy zaawansowaną metodę PPIXpress, która pozwala wykorzystać dane dotyczące ekspresji na poziomie transkryptu, a tym samym jest w stanie ujawnić również zmiany w łączność białek spowodowana alternatywnym splicingiem.
Oryginał publikacji można znaleźć na https://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/4/571 .
Korzyści
- automatyczna konstrukcja sieci interakcji białko-białko
Publiczność
Opieka zdrowotna, nauka/badania naukowe
Interfejs użytkownika
Java Swing, konsola/terminal, wiersz poleceń
Język programowania
Java
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/ppixpress/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
