To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie QUASR, której najnowszą wersję można pobrać jako QUASR_v6.08.tar. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie QUASR z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
QUASR
OPIS
QUASR to lekki potok napisany do przetwarzania i analizowania danych sekwencjonowania nowej generacji (NGS) z platform Illumina, 454 i Ion Torrent. Chociaż pierwotnie napisany dla danych wirusowych, jest wystarczająco ogólny, aby działać na dowolnym zbiorze danych NGS. Funkcje obejmują:
usuwanie duplikatów
demultipleksowanie
usuwanie podkładu
wykresy zapewniania jakości (QA).
kontrola jakości (QC)
generowanie konsensusu
określenie wariantu mniejszościowego
wykresy wariantów mniejszościowych
Główna aktualna wersja to 6.X, która jest napisana w Pythonie3. 7.X to moje przepisanie w Javie, ale wciąż trwają prace nad nim. Oba zostały napisane tak, aby były jak najlżejsze, dzięki czemu mogą działać przy minimalnych wymaganiach dotyczących pamięci na komputerze stacjonarnym lub laptopie, a także w klastrze obliczeniowym.
Jeśli masz jakiekolwiek problemy z QUASR, skontaktuj się ze mną na adres e-mail podany w pliku README.
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Python
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/quasr/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.