Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie RaTrav do działania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako RaTrav.13.09.16.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie RaTrav, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
RaTrav do uruchomienia w systemie Linux online
Ad
OPIS
Narzędzie RaTrav zostało zaprojektowane do wspierania badań biologii obliczeniowej, w których wykorzystuje się średnie czasy pierwszego przejścia (MFPT) między stanem początkowym a pojedynczym lub wieloma stanami końcowymi w systemach podobnych do sieci. Narzędzie zatwierdza dowolne sieci (grafy), w których zachodzi dynamika typu Markowa. Udostępniono dwie metody, których efektywność jest silnie uzależniona od topologii zdefiniowanej sieci: kombinatoryczna technika Hilla oraz metoda symulacji Monte Carlo.Referencje:
M. Torchala, P. Chelminiak, M. Kurzyński i PA Bates, „RaTrav: narzędzie do obliczania średnich czasów pierwszego przejścia w sieciach biochemicznych”, BMC Syst. Biol. 7, 130 (2013).
M. Torchala, P. Chelminiak i PA Bates, „Obliczenia średniego czasu pierwszego przejścia: porównanie deterministycznego algorytmu Hilla z symulacjami Monte Carlo”, Eur. fizyka J. B 85, 116 (2012).
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Konsola/Terminal
Język programowania
C + +
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/ratrav/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.