To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie Seal, której najnowszą wersję można pobrać jako seal-0.4.0-rc2.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie Seal with OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
Seal
Ad
OPIS
Seal to oparty na platformie Hadoop rozproszony zestaw narzędzi do wyrównywania i analizy krótkich odczytów. Obecnie Seal zawiera narzędzia do: demultipleksowania odczytu, wyrównywania odczytu, usuwania duplikatów odczytu, sortowania mapowań odczytu i obliczania statystyk dla empirycznej ponownej kalibracji jakości bazowej. Wagi uszczelnione, łatwo obsługujące TB danych.Zakładka Charakterystyka
- wyrównanie krótkiego odczytu (na podstawie BWA)
- zduplikowana identyfikacja odczytu
- sortuj odczytane mapowania
- obliczyć empiryczne podstawowe tabele rekalibracji jakości
- szybki, skalowalny, niezawodny (działa na Hadoop)
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/biodoop-seal/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
