To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie SplitMEM, której najnowszą wersję można pobrać jako splitmem.1.0.tgz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie SplitMEM z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
PodzielMEM
Ad
OPIS
Wraz z rozwojem ulepszonych technologii sekwencjonowania genomika rozszerza się od pojedynczego paradygmatu odniesienia dla każdego gatunku do bardziej wszechstronnego podejścia obejmującego cały genom, w którym wiele osobników jest reprezentowanych i analizowanych razem. Tutaj przedstawiamy nowatorski algorytm czasu i przestrzeni O(n log n) zwany splitMEM, który bezpośrednio konstruuje skompresowany wykres de Bruijna dla pan-genomu o całkowitej długości n. Aby osiągnąć tę złożoność czasową, rozszerzamy drzewo sufiksów o pominięcia sufiksów – nową konstrukcję, która pozwala nam przechodzić przez kilka łączy sufiksów w stałym czasie i używać ich do wydajnego rozkładania maksymalnych dokładnych dopasowań (MEM) podczas przechodzenia przez drzewo sufiksów.
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
C + +
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/splitmem/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
