Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster do działania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster, aby bezpłatnie działać w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
SWAPHI-LS: Dostosowanie do klastra Xeon Phi do działania w systemie Linux online
Ad
OPIS
Pierwszy równoległy algorytm Smitha-Watermana wykorzystujący klastry Intel Xeon Phi do przyspieszenia dopasowania długich sekwencji DNA. Algorytm ten jest napisany w C++ (z zestawem wewnętrznych rozszerzeń SIMD), OpenMP i MPI. Ocena wydajności wykazała, że nasz algorytm osiąga bardzo stabilną wydajność i zapewnia wydajność do 30.1 GCUPS na jednym Xeon Phi i do 111.4 GCUPS na czterech Xeon Phis współużytkujących hosta.Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Konsola/Terminal, wiersz poleceń
Język programowania
C + +
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
