Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie SWAPHI: Smith-Waterman na platformie Intel Xeon Phi, której najnowszą wersję można pobrać jako swaphi-v1.0.5.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie SWAPHI: Smith-Waterman na procesorze Intel Xeon Phi z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
SWAPHI: Smith-Waterman na Intel Xeon Phi
Ad
OPIS
Pierwszy algorytm równoległy przyspieszający przeszukiwanie bazy danych białek Smitha-Watermana na wielu koprocesorach Intel Xeon Phi ze współdzielonym hostem. Przeszukując bazę danych UniProtKB/TrEMBL, SWAPHI osiąga wydajność do 58.8 miliarda aktualizacji komórek na sekundę (GCUPS) na pojedynczym Xeon Phi i do 228.4 GCUPS na czterech Xeon Phis.
Publiczność
Nauka/badania, edukacja, inżynieria
Interfejs użytkownika
.NET/Mono, konsola/terminal
Język programowania
C++, ALGOL 68
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać ze strony https://sourceforge.net/projects/swaphi/. Został on hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.