Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie VIGOR3 do uruchamiania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako VIGOR3.tgz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie VIGOR3, aby działać w systemie Linux online z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
VIGOR3 do uruchomienia w Linuksie online
OPIS
VIGOR to narzędzie do opisywania genów kodujących w genomach wirusowych. Został opracowany przez Jeffreya Hoovera i Shiliang Wang dla Centrum Sekwencjonowania Genomowego Chorób Zakaźnych JCVI (GSCID).http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
kontakt:
Jeffa Hoovera
301-540-7858
[email chroniony]
Funkcje
- rozumie edycję RNA, poślizg rybosomalny, odczyt kodonów stop i alternatywne kodony startowe
- adnotuje dojrzałe peptydy na poliproteinach
- obsługuje splatane, nakładające się i osadzone geny
- obsługuje genomy kołowe, częściowe i szkicowe (przerwy)
- diagnozuje przesunięcia ramek podczas montażu
- zawiera referencyjne zbiory danych dla ponad 50 gatunków
- zawiera narzędzia do tworzenia nowych referencyjnych zbiorów danych
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Perl
Środowisko bazy danych
SQLite
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/vigor3/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
