To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie Virmid, której najnowszą wersję można pobrać jako Virmid-1.2.0.tar.gz. Można go uruchomić online w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie Virmid z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Wirusowy
OPIS
NEWS:
11-07-2013 Wgrana została nowa wersja Virmid 1.1.0.
08-29-2013 Artykuł Virmid został opublikowany w Genome Biology.
Kim S i wsp., „Virmid: dokładne wykrywanie mutacji somatycznych z wnioskowaniem o zanieczyszczeniu próbki”, Genome Biology 2013, 14: R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid (Virtual Microdissection do wywoływania SNP) to oparty na Javie wariant programu wywołującego przeznaczony do próbek dopasowanych do kontroli choroby. Virmid specjalizuje się również w identyfikowaniu potencjału w obrębie poszczególnych zanieczyszczeń, gdy próbka choroby nie może zostać wystarczająco oczyszczona. Podczas gdy częstotliwość wywoływania SNP jest poważnie zagrożona przez tę heterogeniczność, Virmid może odkryć SNP o niskiej częstotliwości alleli, biorąc pod uwagę poziom zanieczyszczenia (alfa). Ważnymi cechami Virmid są:
•Oszacowanie dokładnej proporcji próbki kontrolnej w próbce (mieszanej) chorej
•Poprawione wywoływanie mutacji SNP i somatycznych w odniesieniu do szacowanej proporcji
Korzyści
- Znalezienie mutacji somatycznej
- Przykładowe wnioskowanie o zanieczyszczeniu
Publiczność
Nauka/Badania
Język programowania
Java
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/virmid/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
