Jest to aplikacja dla systemu Windows o nazwie COV2HTML, której najnowszą wersję można pobrać jako map2cov_4.4_WIN.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie COV2HTML z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom dowolny emulator online systemu operacyjnego OnWorks z tej witryny, ale lepszy emulator online systemu Windows.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Windows, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację i zainstaluj ją.
- 7. Pobierz Wine z repozytoriów oprogramowania dystrybucji Linuksa. Po zainstalowaniu możesz dwukrotnie kliknąć aplikację, aby uruchomić ją za pomocą Wine. Możesz także wypróbować PlayOnLinux, fantazyjny interfejs w Wine, który pomoże Ci zainstalować popularne programy i gry Windows.
Wine to sposób na uruchamianie oprogramowania Windows w systemie Linux, ale bez systemu Windows. Wine to warstwa kompatybilności z systemem Windows typu open source, która może uruchamiać programy systemu Windows bezpośrednio na dowolnym pulpicie systemu Linux. Zasadniczo Wine próbuje ponownie zaimplementować system Windows od podstaw, aby mógł uruchamiać wszystkie te aplikacje Windows bez faktycznego korzystania z systemu Windows.
ZRZUTY EKRANU
Ad
COV2HTML
OPIS
COV2HTML zapewnia łatwy i „domowy” interfejs sieciowy dla biologów, który umożliwia wizualizację pokrycia ułożenia NGS potrzebnego do analizy. Łączy w sobie dwa podstawowe procesy: (i) MAP2COV, narzędzie, które przekształca ogromne pliki mapowania lub pokrycia NGS w pliki pokrycia specyficzne dla światła, które zawierają informacje o elementach genetycznych. (ii) COV2HTML, interfejs wizualizacji umożliwiający analizę danych w czasie rzeczywistym według wybranych kryteriów. W ten sposób interfejs ten oferuje wizualizację danych pokrycia mapowania NGS (sekwencja DNA, sekwencja RNA, sekwencja ChIP i TSS) wykonywana w różnych organizmach prokariotycznych (bakterie, wirusy...) lub w różnych warunkach doświadczalnych (szczepy zmutowane lub szczepy typu dzikiego lub różne stany wzrostu…) ułatwiające badania.
Funkcjonalności
- Wizualizacja pokrycia nici RNA-Seq : Czarny (nić +), Fioletowy (nić -)
- Analiza cech ncRNA
- Obsługiwane są zoomy X i Y
- Zwiększone bezpieczeństwo: HTTPS jako domyślny
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Projekt to system interfejsu użytkownika (UI), Tk
Język programowania
Pythona, PHP
Środowisko bazy danych
MySQL
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/cov2html/. Jest hostowany w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
